MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Syncytium symbiont of Diaphorina citri plasmid

Total Repeats: 168

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021886	T	6	6	4	9	0 %	100 %	0 %	0 %	527317805
2	NC_021886	TAA	2	6	15	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317805
3	NC_021886	ATTA	2	8	21	28	50 %	50 %	0 %	0 %	527317805
4	NC_021886	A	8	8	46	53	100 %	0 %	0 %	0 %	527317805
5	NC_021886	TAG	2	6	153	158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527317805
6	NC_021886	AATT	2	8	170	177	50 %	50 %	0 %	0 %	527317805
7	NC_021886	T	6	6	176	181	0 %	100 %	0 %	0 %	527317805
8	NC_021886	ATT	2	6	184	189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317805
9	NC_021886	CAA	2	6	191	196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527317805
10	NC_021886	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	527317805
11	NC_021886	T	6	6	312	317	0 %	100 %	0 %	0 %	527317805
12	NC_021886	ATA	2	6	335	340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317805
13	NC_021886	TTTA	2	8	381	388	25 %	75 %	0 %	0 %	527317805
14	NC_021886	ATG	2	6	413	418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527317805
15	NC_021886	A	10	10	419	428	100 %	0 %	0 %	0 %	527317805
16	NC_021886	AT	3	6	467	472	50 %	50 %	0 %	0 %	527317805
17	NC_021886	A	10	10	492	501	100 %	0 %	0 %	0 %	527317805
18	NC_021886	T	6	6	532	537	0 %	100 %	0 %	0 %	527317805
19	NC_021886	GATA	2	8	564	571	50 %	25 %	25 %	0 %	527317805
20	NC_021886	AT	4	8	614	621	50 %	50 %	0 %	0 %	527317805
21	NC_021886	TATT	2	8	641	648	25 %	75 %	0 %	0 %	527317805
22	NC_021886	TCT	2	6	667	672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527317805
23	NC_021886	A	6	6	751	756	100 %	0 %	0 %	0 %	527317805
24	NC_021886	AGATTA	2	12	763	774	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	527317805
25	NC_021886	AAG	2	6	776	781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527317805
26	NC_021886	T	7	7	787	793	0 %	100 %	0 %	0 %	527317805
27	NC_021886	A	6	6	796	801	100 %	0 %	0 %	0 %	527317805
28	NC_021886	AAAAT	2	10	821	830	80 %	20 %	0 %	0 %	527317805
29	NC_021886	TAA	3	9	836	844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317805
30	NC_021886	CTT	2	6	845	850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527317805
31	NC_021886	AAAAAC	2	12	880	891	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	527317805
32	NC_021886	ATT	2	6	1014	1019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317806
33	NC_021886	A	6	6	1090	1095	100 %	0 %	0 %	0 %	527317806
34	NC_021886	AGATTA	2	12	1102	1113	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	527317806
35	NC_021886	AAG	2	6	1115	1120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527317806
36	NC_021886	T	7	7	1126	1132	0 %	100 %	0 %	0 %	527317806
37	NC_021886	A	6	6	1135	1140	100 %	0 %	0 %	0 %	527317806
38	NC_021886	AAAAT	2	10	1160	1169	80 %	20 %	0 %	0 %	527317806
39	NC_021886	TAA	3	9	1175	1183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317806
40	NC_021886	CTT	2	6	1184	1189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527317806
41	NC_021886	AAAAAC	2	12	1219	1230	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	527317806
42	NC_021886	TAAT	2	8	1668	1675	50 %	50 %	0 %	0 %	527317807
43	NC_021886	AATA	2	8	1692	1699	75 %	25 %	0 %	0 %	527317807
44	NC_021886	C	8	8	1707	1714	0 %	0 %	0 %	100 %	527317807
45	NC_021886	TAT	4	12	1730	1741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317807
46	NC_021886	AAAT	2	8	1744	1751	75 %	25 %	0 %	0 %	527317807
47	NC_021886	A	6	6	1758	1763	100 %	0 %	0 %	0 %	527317807
48	NC_021886	A	9	9	1799	1807	100 %	0 %	0 %	0 %	527317807
49	NC_021886	A	7	7	1817	1823	100 %	0 %	0 %	0 %	527317807
50	NC_021886	TTA	2	6	1824	1829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317808
51	NC_021886	ATTTT	2	10	1835	1844	20 %	80 %	0 %	0 %	527317808
52	NC_021886	TAT	3	9	1913	1921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317808
53	NC_021886	A	6	6	1941	1946	100 %	0 %	0 %	0 %	527317808
54	NC_021886	TCA	2	6	1981	1986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527317808
55	NC_021886	ATTA	2	8	2007	2014	50 %	50 %	0 %	0 %	527317808
56	NC_021886	CAT	2	6	2027	2032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527317808
57	NC_021886	ATT	2	6	2078	2083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317808
58	NC_021886	T	6	6	2139	2144	0 %	100 %	0 %	0 %	527317808
59	NC_021886	AAT	2	6	2166	2171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317808
60	NC_021886	ATAA	2	8	2191	2198	75 %	25 %	0 %	0 %	527317808
61	NC_021886	A	7	7	2200	2206	100 %	0 %	0 %	0 %	527317808
62	NC_021886	TAA	2	6	2207	2212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317808
63	NC_021886	A	6	6	2244	2249	100 %	0 %	0 %	0 %	527317808
64	NC_021886	AT	3	6	2266	2271	50 %	50 %	0 %	0 %	527317808
65	NC_021886	T	7	7	2276	2282	0 %	100 %	0 %	0 %	527317808
66	NC_021886	CAA	2	6	2287	2292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527317808
67	NC_021886	TCT	2	6	2302	2307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527317808
68	NC_021886	AAT	3	9	2328	2336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317808
69	NC_021886	A	7	7	2354	2360	100 %	0 %	0 %	0 %	527317808
70	NC_021886	TTTA	2	8	2374	2381	25 %	75 %	0 %	0 %	527317808
71	NC_021886	A	6	6	2434	2439	100 %	0 %	0 %	0 %	527317808
72	NC_021886	T	6	6	2442	2447	0 %	100 %	0 %	0 %	527317808
73	NC_021886	A	7	7	2463	2469	100 %	0 %	0 %	0 %	527317808
74	NC_021886	A	6	6	2508	2513	100 %	0 %	0 %	0 %	527317808
75	NC_021886	AGA	2	6	2523	2528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527317808
76	NC_021886	A	6	6	2553	2558	100 %	0 %	0 %	0 %	527317808
77	NC_021886	A	6	6	2561	2566	100 %	0 %	0 %	0 %	527317808
78	NC_021886	TAA	2	6	2567	2572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317808
79	NC_021886	A	7	7	2578	2584	100 %	0 %	0 %	0 %	527317808
80	NC_021886	TCT	2	6	2610	2615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527317808
81	NC_021886	CAATT	2	10	2648	2657	40 %	40 %	0 %	20 %	527317808
82	NC_021886	TAC	2	6	2685	2690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527317808
83	NC_021886	AATT	2	8	2697	2704	50 %	50 %	0 %	0 %	527317808
84	NC_021886	TGTTT	2	10	2709	2718	0 %	80 %	20 %	0 %	527317808
85	NC_021886	A	6	6	2728	2733	100 %	0 %	0 %	0 %	527317808
86	NC_021886	TAT	2	6	2736	2741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317808
87	NC_021886	ATC	2	6	2744	2749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527317808
88	NC_021886	A	8	8	2750	2757	100 %	0 %	0 %	0 %	527317808
89	NC_021886	T	8	8	2763	2770	0 %	100 %	0 %	0 %	527317808
90	NC_021886	ATT	2	6	2784	2789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317808
91	NC_021886	T	8	8	2788	2795	0 %	100 %	0 %	0 %	527317808
92	NC_021886	ATT	2	6	2854	2859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317808
93	NC_021886	AAAT	2	8	2874	2881	75 %	25 %	0 %	0 %	527317808
94	NC_021886	T	6	6	2887	2892	0 %	100 %	0 %	0 %	527317808
95	NC_021886	T	6	6	2906	2911	0 %	100 %	0 %	0 %	527317808
96	NC_021886	CCT	2	6	2920	2925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527317808
97	NC_021886	ATT	2	6	2931	2936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317808
98	NC_021886	GAA	2	6	2972	2977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527317809
99	NC_021886	CAG	2	6	3034	3039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527317809
100	NC_021886	CTA	2	6	3046	3051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527317809
101	NC_021886	ACAA	2	8	3097	3104	75 %	0 %	0 %	25 %	527317809
102	NC_021886	ATTT	2	8	3110	3117	25 %	75 %	0 %	0 %	527317809
103	NC_021886	ATT	3	9	3161	3169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317809
104	NC_021886	A	6	6	3179	3184	100 %	0 %	0 %	0 %	527317809
105	NC_021886	GAAAA	2	10	3244	3253	80 %	0 %	20 %	0 %	527317809
106	NC_021886	ATA	2	6	3271	3276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317809
107	NC_021886	T	7	7	3337	3343	0 %	100 %	0 %	0 %	527317809
108	NC_021886	ATT	2	6	3346	3351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317809
109	NC_021886	A	7	7	3353	3359	100 %	0 %	0 %	0 %	527317809
110	NC_021886	AAG	2	6	3367	3372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527317809
111	NC_021886	TGT	2	6	3418	3423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527317809
112	NC_021886	TAA	2	6	3439	3444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317809
113	NC_021886	TTA	2	6	3487	3492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317809
114	NC_021886	ATT	2	6	3499	3504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317809
115	NC_021886	AGG	2	6	3539	3544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527317809
116	NC_021886	CTT	2	6	3559	3564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527317809
117	NC_021886	AGG	2	6	3620	3625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527317809
118	NC_021886	ATTA	2	8	3647	3654	50 %	50 %	0 %	0 %	527317809
119	NC_021886	TGG	2	6	3671	3676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527317809
120	NC_021886	TAA	2	6	3716	3721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317809
121	NC_021886	TAAA	2	8	3730	3737	75 %	25 %	0 %	0 %	527317809
122	NC_021886	A	6	6	3746	3751	100 %	0 %	0 %	0 %	527317809
123	NC_021886	TAAT	2	8	3796	3803	50 %	50 %	0 %	0 %	527317809
124	NC_021886	TTG	2	6	3816	3821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527317809
125	NC_021886	A	9	9	3839	3847	100 %	0 %	0 %	0 %	527317809
126	NC_021886	ATT	2	6	3884	3889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527317809
127	NC_021886	AT	3	6	3894	3899	50 %	50 %	0 %	0 %	527317809
128	NC_021886	TCA	2	6	3932	3937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527317809
129	NC_021886	T	8	8	3943	3950	0 %	100 %	0 %	0 %	527317809
130	NC_021886	A	6	6	3963	3968	100 %	0 %	0 %	0 %	527317809
131	NC_021886	A	6	6	3989	3994	100 %	0 %	0 %	0 %	527317809
132	NC_021886	TA	3	6	4016	4021	50 %	50 %	0 %	0 %	527317809
133	NC_021886	GTT	2	6	4066	4071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527317809
134	NC_021886	TTC	2	6	4112	4117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527317809
135	NC_021886	GAA	2	6	4131	4136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527317809
136	NC_021886	A	6	6	4148	4153	100 %	0 %	0 %	0 %	527317809
137	NC_021886	A	6	6	4200	4205	100 %	0 %	0 %	0 %	527317809
138	NC_021886	TAA	2	6	4207	4212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527317809
139	NC_021886	TTG	2	6	4354	4359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527317809
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141	NC_021886	TGAT	2	8	4449	4456	25 %	50 %	25 %	0 %	527317809
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.